同一种酶不同物种中的基因如何进行多序列比对?一本科菜鸟求助,哪位大侠伸出援手：我想对植物中的一种酶基因做一个聚类,我在NCBI中搜到了这种酶在不同植物中的基因序列,有complete CDS 也

来源：学生作业帮助网 编辑：作业帮 时间：2024/11/15 23:27:16
同一种酶不同物种中的基因如何进行多序列比对?一本科菜鸟求助,哪位大侠伸出援手：我想对植物中的一种酶基因做一个聚类,我在NCBI中搜到了这种酶在不同植物中的基因序列,有complete CDS 也
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同一种酶不同物种中的基因如何进行多序列比对?一本科菜鸟求助,哪位大侠伸出援手：我想对植物中的一种酶基因做一个聚类,我在NCBI中搜到了这种酶在不同植物中的基因序列,有complete CDS 也
同一种酶不同物种中的基因如何进行多序列比对?
一本科菜鸟求助,哪位大侠伸出援手：
我想对植物中的一种酶基因做一个聚类,我在NCBI中搜到了这种酶在不同植物中的基因序列,有complete CDS 也有partial CDS.我把complete cds的挑出来了.DNAman进行序列比对好像是对相同碱基长度的多序列比对.只是我目前找出的不同植物的同种酶基因的CDS长度不同.请问如何进行比对,挑选出同源性较高的区段?

同一种酶不同物种中的基因如何进行多序列比对?一本科菜鸟求助,哪位大侠伸出援手：我想对植物中的一种酶基因做一个聚类,我在NCBI中搜到了这种酶在不同植物中的基因序列,有complete CDS 也
你所做的工作应该是寻找某个物种中的某一个基因在其它物种中的同源基因（ortholog）然后再做进化树那种吧.进行多序列比对有许多软件都可以做到,DNAman我用的比较多的是alignment而不是multisequence alignment.给你推荐一些软件,一个是clustalx,一个是MEGA,这两个软件都可以进行蛋白多序列比对,而后者我认为更强大些,还可以进行进化树分析.把你所有从NCBI上找到的CDS导入到软件中（一般做同源分析都是用蛋白质序列）.然后用软件进行比对就可以了,结果可以输出为多种形式,比如fasta或者其它格式,软件用法我这里也不多讲了,必须看专用的手册.如果还有不明白就发信息给我

用Clustal呀，DNAman功能不好。

同一种酶不同物种中的基因如何进行多序列比对?一本科菜鸟求助,哪位大侠伸出援手：我想对植物中的一种酶基因做一个聚类,我在NCBI中搜到了这种酶在不同植物中的基因序列,有complete CDS 也 谢谢..那么MEGA或者clustalx可否对不同序列长度的序列做比对?我找出的同一种酶在不同物种中的序列,可长度不等..这样是否也能比较同源性?做进化树就可以吗? 分子生物学高手进,如何进行多物种的基因同源性比对,预测蛋白质等电点,跨膜区域,信号肽,二级结构预测?已知鹌鹑的某基因序列了,不是fasta格式,并从EMBL中下载了其他物种该基因的fasta格式数 想问下各位高人,设计引物时没有所找物种的基因序列,想问下怎么进行多物种序列比对,找到相对保守区域呢希望各位能给与详细指导,谢谢大家 不同物种之间怎样进行基因交流 关于一段NCBI上没有的基因序列该基因在NCBI上没有登录,但是同目物种的该基因有.通过基因的电子克隆未果.通过同目物种的该基因的同源性分析,用同源性高的序列与该物种的EST库进行比较,无 怎样进行基因组中基因功能相似的多条基因序列进行多序列比对? 比较不同物种中的HOX基因 为什么自然条件下,不同物种之间不可进行基因交流? 为什么自然条件下,不同物种之间不可进行基因交流?为什么又说不同物种间可以进行基因交流? 荧光定量PCR的引物如何设计..新手想问一下...做几个基因的定量.然后这几个基因的序列似乎没有,只在相近物种中的序列已经测过了....需要先做什么测序么 如何将植物基因序列与拟南芥进行同源性分析? 求助简并引物的设计克隆一个基因,该物种的序列不知道,根据其他物种该基因的序列进行同源比对后设计,是氨基酸比对好些,还是CDS比对好些啊?另外比对之后具体该怎么操作啊.在下是新手,希 怎样查找一种病毒蛋白所有不同亚型的基因序列?我想比对一下我这个蛋白的序列保守型, 如何进行两蛋白质序列比对? 如何测定一种生物的全基因序列 我在网上找到的同一物种的两个基因,对它们序列进行了核酸比对,相似度为65%,氨基酸比对相似度为96%这样能证明这两个就是同一个基因么 同一物种不同条件下差异表达基因如何寻找?