请问如何使用blast进行多序列两两比对

请问如何使用blast进行多序列两两比对 如何进行两蛋白质序列比对? 如何使用DNAMAN软件进行多重序列比对 ncbi上的blast序列比对工具怎么使用,求具体操作指南. 在Blast里面进行序列比对,相似度主要看哪个值 如何进行BLAST比对?急救啊,朋友!本人是新手,获得了未知菌的16Srdna序列后,进入http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/中进行比对,页面中有BLAST Assembled Genomes和Basic BLAST之分,请教我该进入哪里,我不知道该把 克隆未知基因的序列,测序后BLAST进行了比对,是我们想要的序列,接下来对序列还要进行什么分析? 如何进行序列同源性分析及BLAST同源性步骤 使用blast进行蛋白质双序列比对,出现警告.如题,在用本地blast进行蛋白质双序列比对的时候,出现如下的警告Warning: lcl|Query_1 ENSG00000077782: Warning: One or more U or O characters replaced by X for alignment score 如何用blast比对两个蛋白质序列,看它们之间有多高的同源性有同一家族两种蛋白质,我想知道它们之间的同源性有多高,除了比较序列外,还可以怎么分析? 实时定量PCR 引物设计的问题,进行Blast后找出一堆序列,请问保守区域是如何找的呢?我以前是先排列,然后在Ugene打开的文件中25个25个的比对,找不匹配小于3个碱基的片段. 菜鸟,想进行多序列blast,就5个序列,谁能教教 如何使用DNAMAN软件将测序的序列翻译成氨基酸序列?怎么和已知的基因进行比对?麻烦具体点,非常感 请问怎样剔除测序结果中的引物序列,进行BLAST 将扩增的序列进行blast,相似性偏低,要如何处理? Clustalx是多条序列比对软件,为什么需要设置两条序列比对的参数? 如何确定这个是否是我要的目的基因序列?本人需要获得一个未知的基因,通过设计引物PCR扩增获得了一个片段,但是在进行Blast比对时,选择Highly similar sequence 的话找不到显著相似的序列,而选择 BLAST 蛋白比对求助请问测序结果和已公开序列的基因蛋白比对为99%,能否确定其为新基因还是未公开序列的基因中的某个?还需要做什么?