使用blast进行蛋白质双序列比对,出现警告.如题,在用本地blast进行蛋白质双序列比对的时候,出现如下的警告Warning: lcl|Query_1 ENSG00000077782: Warning: One or more U or O characters replaced by X for alignment score

来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/11/15 21:02:23
使用blast进行蛋白质双序列比对,出现警告.如题,在用本地blast进行蛋白质双序列比对的时候,出现如下的警告Warning: lcl|Query_1 ENSG00000077782: Warning: One or more U or O characters replaced by X for alignment score
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使用blast进行蛋白质双序列比对,出现警告.如题,在用本地blast进行蛋白质双序列比对的时候,出现如下的警告Warning: lcl|Query_1 ENSG00000077782: Warning: One or more U or O characters replaced by X for alignment score
使用blast进行蛋白质双序列比对,出现警告.
如题,在用本地blast进行蛋白质双序列比对的时候,出现如下的警告
Warning: lcl|Query_1 ENSG00000077782: Warning: One or more U or O characters rep
laced by X for alignment score calculations at positions 3, 8
不知道是什么意思,对结果会不会产生很大的影响?

使用blast进行蛋白质双序列比对,出现警告.如题,在用本地blast进行蛋白质双序列比对的时候,出现如下的警告Warning: lcl|Query_1 ENSG00000077782: Warning: One or more U or O characters replaced by X for alignment score
出现这个警告是因为序列内部有非ATCG的未知碱基,不会对结果有太大影响,做blast很容易出现这种警告

使用blast进行蛋白质双序列比对,出现警告.如题,在用本地blast进行蛋白质双序列比对的时候,出现如下的警告Warning: lcl|Query_1 ENSG00000077782: Warning: One or more U or O characters replaced by X for alignment score 请问如何使用blast进行多序列两两比对 如何进行两蛋白质序列比对? ncbi上的blast序列比对工具怎么使用,求具体操作指南. 在Blast里面进行序列比对,相似度主要看哪个值 克隆未知基因的序列,测序后BLAST进行了比对,是我们想要的序列,接下来对序列还要进行什么分析? 如何使用DNAMAN软件进行多重序列比对 如何进行BLAST比对?急救啊,朋友!本人是新手,获得了未知菌的16Srdna序列后,进入http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/中进行比对,页面中有BLAST Assembled Genomes和Basic BLAST之分,请教我该进入哪里,我不知道该把 用primer-blast检测引物的时候 为什么比对结果中出现要扩增基因的mRNA序列?用cDNA设计的隐物 如何用blast比对两个蛋白质序列,看它们之间有多高的同源性有同一家族两种蛋白质,我想知道它们之间的同源性有多高,除了比较序列外,还可以怎么分析? 基因序列BLAST比对时,Max ident 低于90%,可以做进化分析吗? NCBI Blast 中的黑色、蓝色、绿色、粉色和红色都是什么意思?在 NCBI 中进行核酸序列比对,比对结果的 Graphic Summary 中会有黑色、蓝色、绿色、粉色和红色的代表一些数值的标记, 如何进行序列同源性分析及BLAST同源性步骤 双序列比对和多序列比对,哪种方法更能揭示蛋白质功能相关的保守序列片段?为什么? 运用NCBI-BLAST和PDB搜索工具搜P03958序列的相似序列和相似的结构,并对结果进行解? blast检验引物特异性NCBI上没有我所要物种的某基因序列,设计引物时我用人的序列做模版,想问下还有没有blast比对的意义,如果有该怎样去比对呢, GKVVLIVNLAT DIRWNFEKFLI是我经蛋白质比对后选取的两个保守序列 怎么进行简并引物的设计 全序列为malhedkriplseysgkvvlivnlatyglnfqyhelnvlqetfpedfvitgfpcnqfalqepaangtelidglmhvrpgngfepnfrlfgkvevngenetplysylkescpstmdefmrsemlhya 有谁知道NCBI blast检测基因序列比对结果怎么看的吗?求懂的大神们指教